Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc113Q8C5T8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms