Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccser1Q8C0C4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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