Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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