Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdca8Q8BHX3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms