Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms