Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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