Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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