Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed4Q80WQ9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Zbed4Q80WQ9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Zbed4Q80WQ9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Zbed4Q80WQ9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Zbed4Q80WQ9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Zbed4Q80WQ9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms