Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrc2bQ7TPM1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms