Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Trappc6aQ78XR0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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