Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccdc88cQ6VGS5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc88cQ6VGS5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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