Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd4Q6PDQ2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms