Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop58Q6DFW4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nop58Q6DFW4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms