Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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