Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slain1Q68FF7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Slain1Q68FF7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms