Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CltcQ68FD5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CltcQ68FD5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms