Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall3Q62255 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms