Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Lrrn1Q61809 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrrn1Q61809 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms