Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms