Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sin3aQ60520 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sin3aQ60520 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms