Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf123Q5XPI3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms