Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Slc5a6Q5U4D8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms