Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim38Q5SZ99 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms