Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim58Q5NCC9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim58Q5NCC9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms