Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms