Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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