Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6899Q3USS0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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