Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm28047Q3US59 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28047Q3US59 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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