Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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