Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms