Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Skap2Q3UND0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms