Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp30Q3UN04 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms