Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms