Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms