Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf6Q3TWW8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms