Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc10Q3TLI0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms