Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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