Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim71Q1PSW8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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