Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq1Q0P5X1 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq1Q0P5X1 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq1Q0P5X1 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrriq1Q0P5X1 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms