Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrioQ0KL02 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms