Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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