Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MestQ07646 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MestQ07646 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MestQ07646 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms