Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms