Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sox10Q04888 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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