Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Thbs2Q03350 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms