Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EgfrQ01279 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms