Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms