Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms