Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Polr1bP70700 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms