Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NficP70255 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms